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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
22/11/2017 |
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Data da última atualização: |
21/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAMPOS, B. M.; CARMO, A. S. do; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. S. M. do; GOUVEIA, J. J. S. de; MALHADO, C. H. M.; VERARDO, L. L.; SILVA, M. V. G. B. da; CARNEIRO, P. L. S. |
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Afiliação: |
BÁRBARA MACHADO CAMPOS, UESB; ADRIANA SANTANA DO CARMO, UFG; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; ARTHUR DA SILVA MARIANTE, Cenargen; MARIA DO SOCORRO MAUES ALBUQUERQUE, Cenargen; JOÃO JOSÉ SIMONI DE GOUVEIA, UNIVASF; CARLOS HENRIQUE MENDES MALHADO, UESB; LUCAS LIMA VERARDO; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAULO LUIZ SOUZA CARNEIRO, UESB. |
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Título: |
Genetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Animal Health and Production, v. 49, n. 8, p 1677-1684, 2017. |
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DOI: |
10.1007/s11250-017-1376-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Genetic diversity is one of the most important issues in studies on conservation of cattle breeds and endangered species. The objective of this study was to estimate the levels of genetic differentiation between locally adapted taurine (Bos taurus taurus) and zebu (Bos taurus indicus) breeds in Brazil, which were genotyped for more than 777,000 SNPs. The fixation index (FST), principal component analysis (PCA), and Bayesian clustering were estimated. The FST highlighted genetic differentiation between taurine and zebu breeds. The taurine lines, Caracu and Caracu Caldeano, had significant genetic differentiation (FST close to 5%) despite their recent selection for different uses (meat and milk). This genetic variability can be used for conservation of locally adapted animals, as well as for breeding programs on zebu breeds. Introgression of zebu in locally adapted breeds was identified, especially in Curraleiro Pé-Duro breed. The Gyr breed, however, had low breed purity at genomic level due to its very heterogeneous mixing pattern. |
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Palavras-Chave: |
Conservation; Naturalized bovine. |
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Thesaurus Nal: |
Genomics; Introgression. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181022/1/Campos2017-Article-GeneticDiversityPopulationStru.pdf
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Marc: |
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245 $aGenetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers.$h[electronic resource]
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520 $aAbstract Genetic diversity is one of the most important issues in studies on conservation of cattle breeds and endangered species. The objective of this study was to estimate the levels of genetic differentiation between locally adapted taurine (Bos taurus taurus) and zebu (Bos taurus indicus) breeds in Brazil, which were genotyped for more than 777,000 SNPs. The fixation index (FST), principal component analysis (PCA), and Bayesian clustering were estimated. The FST highlighted genetic differentiation between taurine and zebu breeds. The taurine lines, Caracu and Caracu Caldeano, had significant genetic differentiation (FST close to 5%) despite their recent selection for different uses (meat and milk). This genetic variability can be used for conservation of locally adapted animals, as well as for breeding programs on zebu breeds. Introgression of zebu in locally adapted breeds was identified, especially in Curraleiro Pé-Duro breed. The Gyr breed, however, had low breed purity at genomic level due to its very heterogeneous mixing pattern.
650 $aGenomics
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773 $tTropical Animal Health and Production$gv. 49, n. 8, p 1677-1684, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pantanal. Para informações adicionais entre em contato com cpap.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
04/02/2011 |
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Data da última atualização: |
15/02/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 3 |
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Autoria: |
PICOLOTO, G.; LIMA, R. F. de; OLEGÁRIO, L. A. O.; CARVALHO, C. M. E.; LACERDA, A. C. R.; TOMAS, W. M.; LIMA BORGES, P. A.; PELLEGRIN, A. O.; MADRUGA, C. R. |
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Afiliação: |
GRAZIELA PICOLOTO, UFMS; RENILEIDE FERREIRA DE LIMA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; LÍLIAN ANDRESSA OLIVEIRA OLEGÁRIO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; CRISTIANO MIRANDA ESPÍNDOLA CARVALHO, UNIVERSIDADE CATÓLICA DOM BOSCO; ANA CRYSTINA REIS LACERDA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; WALFRIDO MORAES TOMAS, CPAP; PAULO ANDRÉ LIMA BORGES; AIESCA OLIVEIRA PELLEGRIN, CPAP; CLÁUDIO ROBERTO MADRUGA, UFMS. |
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Título: |
Real time polymerase chain reaction to diagnose Anaplasma marginale in cattle and deer (Ozotoceros bezoarticus leucogaster) of the Brazilian Pantanal. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 19, n. 3, p. 186-188, jul.-set. 2010. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Reação da polimerase em cadeia tempo real para diagnóstico de Anaplasma marginale em bovino e veado campeiro do Pantanal brasileiro Ozotoceros bezoarticus leucogaster. |
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Conteúdo: |
Epizootiological study of Anaplasma marginale in regions that contain various reservoir hosts, co-existence of rickettsia pathogens, and common vectors is a complicated task. To achieve diagnosis of this rickettsia in cattle and campeiro deer of Brazilian Pantanal, a comparison was made between a real time polymerase chain reaction (RT-PCR) with intercalating Sybr Green fluorochrome and primers based on msp5 gene of A. marginale; a conventional PCR (C-PCR); and parasitological examination using thin blood smear stained with Giemsa-MayGrunwald. Both PCRs showed good performance in the diagnosis of A. marginale in cattle, and were superior to the parasitological exam. The RT-PCR detected seven positive campeiro deer (16.3%). This rate was significantly higher compared to C-PCR, which identified one animal as positive (2.3%), and also compared to parasitological diagnosis, which did not find any positive animals. The dissociation temperature average of positive reactions in cattle (81.72 °C ± 0.20) was identical to dissociation temperature found in the cervids (81.72 °C ± 0.12), suggesting that both animal species were infected with A. marginale. We concluded that RT-PCR can be used for A. marginale diagnosis and in epizootiological studies of cattle and cervids; in spite of the small number of campeiro deer samples, the results indicated that this wildlife species has importance in the Anaplasma epizootiology in the Brazilian Pantanal.
O estudo epizootiológico de Anaplasma marginale em regiões que existem vários reservatórios, co-existência de espécies de riquétsias patógenas e vetores comuns é uma tarefa complicada. Com o objetivo de obter o diagnóstico dessa riquétsia em bovinos e veado campeiro do Pantanal brasileiro foi avaliada uma reação da polimerase em cadeia em tempo real (PCR‑TR) com o fluoróforo intercalante de fita dupla de DNA Sybr Green e iniciadores baseados na seqüência do gene msp5 de A. marginale comparando-a a uma PCR convencional (PCR-C) e ao exame parasitológico de esfregaço fino de sangue corado com Giemsa-MayGrunwald. Ambas PCRs apresentaram bom desempenho no diagnóstico de A. marginale nos bovinos, o qual foi superior ao exame parasitológico. O PCR-TR detectou sete veados campeiros positivos (16,3%), o que foi significativamente maior comparado ao PCR-C identificando um animal como positivo (2,3%), e ao exame parasitológico não encontrou nenhum animal positivo. A média da temperatura de dissociação das reações positivas para amostras de
bovinos (81,72 °C ± 0,20) foi idêntica àquelas dos cervídeos ( 81,72 °C ± 0,12), o que sugere que ambas espécies animais foram infectadas por A. marginale. Concluímos que PCR-TR pode ser utilizada para diagnóstico e estudos epizootiológicos de A. marginale em bovinos e cervídeos. Apesar da pequena amostragem de veado campeiro os resultados indicam que essa espécie de animal selvagem tem importância na epizootiologia do Anaplasma no Pantanal brasileiro. MenosEpizootiological study of Anaplasma marginale in regions that contain various reservoir hosts, co-existence of rickettsia pathogens, and common vectors is a complicated task. To achieve diagnosis of this rickettsia in cattle and campeiro deer of Brazilian Pantanal, a comparison was made between a real time polymerase chain reaction (RT-PCR) with intercalating Sybr Green fluorochrome and primers based on msp5 gene of A. marginale; a conventional PCR (C-PCR); and parasitological examination using thin blood smear stained with Giemsa-MayGrunwald. Both PCRs showed good performance in the diagnosis of A. marginale in cattle, and were superior to the parasitological exam. The RT-PCR detected seven positive campeiro deer (16.3%). This rate was significantly higher compared to C-PCR, which identified one animal as positive (2.3%), and also compared to parasitological diagnosis, which did not find any positive animals. The dissociation temperature average of positive reactions in cattle (81.72 °C ± 0.20) was identical to dissociation temperature found in the cervids (81.72 °C ± 0.12), suggesting that both animal species were infected with A. marginale. We concluded that RT-PCR can be used for A. marginale diagnosis and in epizootiological studies of cattle and cervids; in spite of the small number of campeiro deer samples, the results indicated that this wildlife species has importance in the Anaplasma epizootiology in the Brazilian Pantanal.
O estudo epizootiológico de Anaplasma ma... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Campeiro deer; PCR tempo real; Real time PCR. |
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Thesagro: |
Anaplasma Marginale; Bovino; Veado Campeiro. |
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Thesaurus NAL: |
cattle; Pantanal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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245 $aReal time polymerase chain reaction to diagnose Anaplasma marginale in cattle and deer (Ozotoceros bezoarticus leucogaster) of the Brazilian Pantanal.
260 $c2010
500 $aTítulo em português: Reação da polimerase em cadeia tempo real para diagnóstico de Anaplasma marginale em bovino e veado campeiro do Pantanal brasileiro Ozotoceros bezoarticus leucogaster.
520 $aEpizootiological study of Anaplasma marginale in regions that contain various reservoir hosts, co-existence of rickettsia pathogens, and common vectors is a complicated task. To achieve diagnosis of this rickettsia in cattle and campeiro deer of Brazilian Pantanal, a comparison was made between a real time polymerase chain reaction (RT-PCR) with intercalating Sybr Green fluorochrome and primers based on msp5 gene of A. marginale; a conventional PCR (C-PCR); and parasitological examination using thin blood smear stained with Giemsa-MayGrunwald. Both PCRs showed good performance in the diagnosis of A. marginale in cattle, and were superior to the parasitological exam. The RT-PCR detected seven positive campeiro deer (16.3%). This rate was significantly higher compared to C-PCR, which identified one animal as positive (2.3%), and also compared to parasitological diagnosis, which did not find any positive animals. The dissociation temperature average of positive reactions in cattle (81.72 °C ± 0.20) was identical to dissociation temperature found in the cervids (81.72 °C ± 0.12), suggesting that both animal species were infected with A. marginale. We concluded that RT-PCR can be used for A. marginale diagnosis and in epizootiological studies of cattle and cervids; in spite of the small number of campeiro deer samples, the results indicated that this wildlife species has importance in the Anaplasma epizootiology in the Brazilian Pantanal. O estudo epizootiológico de Anaplasma marginale em regiões que existem vários reservatórios, co-existência de espécies de riquétsias patógenas e vetores comuns é uma tarefa complicada. Com o objetivo de obter o diagnóstico dessa riquétsia em bovinos e veado campeiro do Pantanal brasileiro foi avaliada uma reação da polimerase em cadeia em tempo real (PCR‑TR) com o fluoróforo intercalante de fita dupla de DNA Sybr Green e iniciadores baseados na seqüência do gene msp5 de A. marginale comparando-a a uma PCR convencional (PCR-C) e ao exame parasitológico de esfregaço fino de sangue corado com Giemsa-MayGrunwald. Ambas PCRs apresentaram bom desempenho no diagnóstico de A. marginale nos bovinos, o qual foi superior ao exame parasitológico. O PCR-TR detectou sete veados campeiros positivos (16,3%), o que foi significativamente maior comparado ao PCR-C identificando um animal como positivo (2,3%), e ao exame parasitológico não encontrou nenhum animal positivo. A média da temperatura de dissociação das reações positivas para amostras de bovinos (81,72 °C ± 0,20) foi idêntica àquelas dos cervídeos ( 81,72 °C ± 0,12), o que sugere que ambas espécies animais foram infectadas por A. marginale. Concluímos que PCR-TR pode ser utilizada para diagnóstico e estudos epizootiológicos de A. marginale em bovinos e cervídeos. Apesar da pequena amostragem de veado campeiro os resultados indicam que essa espécie de animal selvagem tem importância na epizootiologia do Anaplasma no Pantanal brasileiro.
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650 $aBovino
650 $aVeado Campeiro
653 $aCampeiro deer
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700 1 $aMADRUGA, C. R.
773 $tRevista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal$gv. 19, n. 3, p. 186-188, jul.-set. 2010.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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